Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms