Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms