Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csde1Q91W50 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms