Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39cQ8VE09 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ttc39cQ8VE09 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ttc39cQ8VE09 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc39cQ8VE09 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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