Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms