Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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