Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf183Q8QZS5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf183Q8QZS5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf183Q8QZS5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf183Q8QZS5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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