Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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