Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms