Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccm2Q8K2Y9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccm2Q8K2Y9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccm2Q8K2Y9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccm2Q8K2Y9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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