Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn34c1Q8K193 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn34c1Q8K193 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn34c1Q8K193 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms