Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem17Q8K0U3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms