Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SbsnQ8CIT9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SbsnQ8CIT9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SbsnQ8CIT9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SbsnQ8CIT9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SbsnQ8CIT9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SbsnQ8CIT9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SbsnQ8CIT9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SbsnQ8CIT9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SbsnQ8CIT9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SbsnQ8CIT9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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