Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms