Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lancl3Q8CD19 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lancl3Q8CD19 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms