Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp20Q8C6M1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms