Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka5Q8C050 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms