Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Als2cr12Q8BVM7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Als2cr12Q8BVM7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Als2cr12Q8BVM7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Als2cr12Q8BVM7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Als2cr12Q8BVM7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Als2cr12Q8BVM7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Als2cr12Q8BVM7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms