Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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