Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod1Q8BVA4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms