Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops7bQ8BV13 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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