Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnpy4Q8BQ47 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cnpy4Q8BQ47 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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