Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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