Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms