Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms