Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp1Q8BJQ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp1Q8BJQ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Usp1Q8BJQ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms