Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms