Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubash3bQ8BGG7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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