Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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