Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pknox2Q8BG99 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pknox2Q8BG99 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms