Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc50Q810U5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms