Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc181Q80ZU5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms