Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5bQ80Y84 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5bQ80Y84 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms