Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Atg2bQ80XK6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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