Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc28Q80XJ3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms