Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms