Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms