Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lamp3Q7TST5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms