Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vtcn1Q7TSP5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vtcn1Q7TSP5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vtcn1Q7TSP5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vtcn1Q7TSP5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vtcn1Q7TSP5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms