Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1bQ7TSF1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms