Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms