Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nphp3Q7TNH6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nphp3Q7TNH6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms