Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf2Q7TMI3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms