Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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