Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snd1Q78PY7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms