Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms