Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms