Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncapd3Q6ZQK0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms