Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms