Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms